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技術(shù)服務(wù)基因編輯
Gene editing
基因編輯
CRISPR-Cas 系統(tǒng)是原核生物的一種應(yīng)對病毒(如噬菌體)入侵的免疫系統(tǒng),其結(jié)構(gòu)包括:規(guī)律成簇的間隔短回文重復(fù)序列CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats),前導(dǎo)序列Leader,Cas基因序列Cas gene,以及反式激活CRISPR RNA(trans-activating CRISPR RNA,tracrRNA) 序列。該系統(tǒng)主要分為 Type Ⅰ、Type Ⅱ、Type Ⅲ 3種不同類型,其中Type Ⅱ系統(tǒng)只有一種核酸酶參與,即Cas9。CRISPR-Cas9在細(xì)菌中起到的作用就是識別入侵的病毒,將其基因組片段錄入自己的基因組,當(dāng)病毒再次入侵時候,切割其DNA或RNA進(jìn)而消除感染。

CRISPR-Cas9系統(tǒng)在編輯基因的時候,需要2個組成部分:Cas9核酸酶和sgRNA(single guide RNA,引導(dǎo)RNA)。Cas9和sgRNA會形成一個Cas9核糖核蛋(ribonucleoprotein,RNP)。這個RNP能結(jié)合到基因組的靶序列上?;蚪M的靶序列如果要被切割,需要滿足兩個條件:第一,sgRNA與基因組上有17-21個堿基的同源區(qū),也被稱為前間隔序列protospacer。第二,靶序列附近有前間隔序列鄰近基序PAM(protospacer adjacent motif),需要注意的是,在設(shè)計(jì)sgRNA時,PAM并不是sgRNA的一部分。在滿足上述兩個條件后,在tracrRNA引導(dǎo)下,sgRNA與基因組的靶序列結(jié)合,進(jìn)而RNP在PAM上游4到5個堿基的位置切割靶序列,形成一個DNA雙鏈損傷(DSB)。
 
在經(jīng)過CRISPR-Cas9系統(tǒng)切割并產(chǎn)生DNA雙鏈損傷后,哺乳動物細(xì)胞會啟動兩種常見的DNA修復(fù)機(jī)制對斷裂進(jìn)行修復(fù),即非同源末端連接機(jī)制NHEJ和同源定向修復(fù)機(jī)制HDR。利用NHEJ機(jī)制的易錯性和HDR的同源重組特性,從而實(shí)現(xiàn)對靶基因的敲除、敲入、定點(diǎn)突變以及定點(diǎn)修復(fù)等目的。
 
CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)現(xiàn)已風(fēng)靡全球,沒有哪種技術(shù)的普及與進(jìn)展速度能與其比肩。2020年諾貝爾化學(xué)獎授予了法國女科學(xué)家?,敿~埃勒·沙爾龐捷和美國女科學(xué)家珍妮弗·杜德納,以表彰她們在基因組編輯方法研究領(lǐng)域做出的貢獻(xiàn)。CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)的應(yīng)用包括但不限于:
1、用于基因敲除(沉默)或敲入(點(diǎn)突變、標(biāo)簽等);
2、通過單堿基突變等用于基因修復(fù)(如白內(nèi)障);
3、阻止靶基因mRNA轉(zhuǎn)錄以進(jìn)行基因表達(dá)調(diào)控;
4、適合構(gòu)建抗性基因文庫,進(jìn)行大規(guī)模文庫篩選;
5、在活細(xì)胞中監(jiān)測染色體的構(gòu)象變化或基因分布等。
CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)
現(xiàn)在國內(nèi)外高??蒲袡C(jī)構(gòu)及商業(yè)市場對CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)的開發(fā)、改進(jìn)和應(yīng)用仍處在上升期,該技術(shù)本身雖已相對成熟并在生物醫(yī)藥領(lǐng)域突顯了優(yōu)勢,但仍然有其亟待解決的缺陷。CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)主要體現(xiàn)在方面:
 
首先,因?yàn)橹恍枰ㄟ^設(shè)計(jì)短片段的sgRNA,即可對大多數(shù)區(qū)域的基因進(jìn)行編輯,所以該技術(shù)具有成本低、使用方便、構(gòu)建簡單的優(yōu)點(diǎn)。
但因?yàn)橘|(zhì)粒較大,導(dǎo)致轉(zhuǎn)染仍具有一定難度,且堿基識別具有偏好性,限制了其應(yīng)用范圍,同時也導(dǎo)致不同基因位點(diǎn)編輯效率不同,仍需要耗費(fèi)大量時間進(jìn)行篩選。

雖然已經(jīng)對體系進(jìn)行了優(yōu)化,但該技術(shù)仍具有較高的脫靶率,會降低編輯效率和導(dǎo)致設(shè)想外的其他基因改變,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

雖然有上述的缺點(diǎn),但還是無法阻礙CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)成為當(dāng)下發(fā)展最快,且應(yīng)用最廣的基因編輯技術(shù)。

 
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