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技術(shù)資訊技術(shù)資料
【賽庫生物】帶您詳細了解細胞STR鑒定
發(fā)布日期:2022.12.02
 
 

為什么要進行細胞系鑒定?

 

 

 

 

據(jù)統(tǒng)計,目前有超過30%的細胞系被錯誤辨識或受到交叉污染。2010年《國際癌癥雜志》(IJC)統(tǒng)計出一列表,在346篇文章中,有103篇存在細胞被Hela細胞污染的情況。最可怕的錯用是在瑞典某大學(xué)的一個研究組里,該研究組從1988年起就錯誤的使用了Hela,以為是lnt-407細胞系,并因此在從1988到2011年里發(fā)表了41篇論文,全部是錯的。這些文章發(fā)在Oncogen, JBCCarcinogenesisPLoS OneJ Cell PhysiolCancer ResBr J CancerBiochem JExp Cell Res等眾多高質(zhì)量的雜志上。

 

 

近年來,大量研究表明 STR 基因分型方法是進行細胞交叉污染和性質(zhì)鑒定的最有效和準確的方法之一,STR基因分型應(yīng)用于細胞鑒定已被ATCC等機構(gòu)強烈推薦。美國的ATCC 細胞庫、德國的DSMZ細胞庫以及日本的JCRB細胞庫等為STR 分型提供了各細胞株的數(shù)據(jù)供比對。越來越多的雜志在投稿時要求撰稿人提供細胞STR分析數(shù)據(jù),STR已被ATCC等機構(gòu)作為細胞鑒定的金標(biāo)準。

 

什么是細胞系STR鑒定?

 

 

● STR(Short tandem repeats,短串聯(lián)重復(fù)序列)基因位點由長度為3~7個堿基對的短串聯(lián)重復(fù)序列組成,這些重復(fù)序列廣泛存在于基因組中,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱為細胞的DNA指紋,其可通過PCR(聚合酶鏈式反應(yīng))來檢測。

 

● STR基因座位上的等位基因可通過擴增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法,所得的STR分型結(jié)果與權(quán)威的細胞STR數(shù)據(jù)庫比對,從而推算出樣品所屬的細胞系。

 

 

圖片來源于網(wǎng)絡(luò)

 

 

鑒定流程

 

 

什么時候需要細胞系STR鑒定?

 

 

 

 

發(fā)表文章或申請課題經(jīng)費前;

使用細胞進行臨床治療(試驗)前

準備凍存保種或已凍存多年的細胞;

 

一個涉及到細胞試驗項目開始/結(jié)束時;

新得到的細胞或?qū)嶒炇遗囵B(yǎng)5代以上的細胞

細胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大;

 

異體細胞移植后嵌合情況檢查。

 

這樣將避免由于細胞系交叉污染或身份誤認,導(dǎo)致的金錢、時間的浪費和無效實驗數(shù)據(jù)的產(chǎn)生。

 

 

人源細胞的鑒定-STR鑒定

 

 

STR基因分型已被ICLAC、ATCC等權(quán)威機構(gòu)作為金標(biāo)準應(yīng)用于細胞鑒定,目前主要基于國際身份認證委員會的標(biāo)準。依據(jù)該標(biāo)準,可以通過多重?zé)晒釶CR技術(shù),對人源常見的20個STR位點以及1個性別決定位點進行檢測。

 

 

圖片來源于網(wǎng)絡(luò)

 

 

 

人源細胞STR位點信息
 
 
 
人源細胞系21基因位點STR分型圖譜
 
 
 

 

小鼠細胞的鑒定-STR鑒定

 

 

 

國內(nèi)STR基因分型常見人類STR,當(dāng)科研用到小鼠源細胞,該怎么提供STR鑒定結(jié)果呢

 

賽庫是國內(nèi)首家推出小鼠源細胞STR鑒定的生物公司,參考ATCC細胞鑒定金標(biāo)準ANSI/ATCC ASN-0002-2011——STR基因分型技術(shù),創(chuàng)建小鼠源細胞DNA指紋檢測系統(tǒng),聯(lián)用18個位點(人源細胞系鑒定我們采用21位點),多種熒光探針標(biāo)記,精準鑒別小鼠源細胞。賽庫生物擁有5年以上細胞鑒定經(jīng)驗,為您提供專業(yè)的細胞鑒定服務(wù)。

 

 
 

 

 

小鼠細胞STR位點信息
 
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國際權(quán)威機構(gòu)已STR驗證的小鼠細胞系(株)名單
 
 
 

樣品要求

 

 

 

樣品要求

 

活細胞:T25培養(yǎng)瓶,60%-70%密度,細胞數(shù)>106個,寄出前灌滿培養(yǎng)基封口膜密封蓋子,常溫運輸。

 

細胞沉淀/凍存細胞:細胞數(shù)量需≥106,干冰運輸。

 

DNA樣本:OD260/OD280=1.8~2.0,DNA濃度≥50ng/uL,DNA體積≥20uL。

 

 

附件
 

賽庫生物--小鼠短串聯(lián)重復(fù)序列的多重擴增體系及檢測試劑盒發(fā)明專利

 
 
 
020-89449936/19303062859
  • [email protected]
  • 廣州市海珠區(qū)廣州國際生物島標(biāo)產(chǎn)一期辦公區(qū)一棟102-104單元
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